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戊二醛是一种高效消毒剂，具有杀菌谱广、杀细菌芽孢效果可靠、杀菌作用受有机物影响较小、对金属腐蚀性小等特点，适用于不耐热的医疗器械和精密仪器的消毒与灭菌，尤其是内窥镜的消毒灭菌。

物理化学性质
戊二醛是一种饱和五碳二醛，分子式为C5H8O2，纯品为无色或浅黄色油状液体，有微弱的醛气味，易溶于水和醇，戊二醛水溶液呈酸性。戊二醛在酸性条件下稳定，可长期贮存，商业出售的戊二醛通常是质量分数为2%、25%、50%的酸性溶液。消毒用的戊二醛通常为2%的碱性溶液，酸性溶液在使用之前需活化（碱性化）。碱性条件下戊二醛不稳定，易聚合成多聚体，pH≥8的溶液通常在4周内失去活性，活化的碱性戊二醛使用时间不应超过两周。

对微生物的杀灭作用
戊二醛杀灭微生物的机理还不清楚，可能是自由醛基与细胞壁中的氨基酸结合，使得微生物无法摄取养分与排出废物，从而引起微生物的死亡。戊二醛与蛋白质和酶的反应速率取决于溶液的酸碱度，在pH4～9范围内，随着pH值的增加，反应速率增加。